Selon l'église, le révérend Paisley devrait démissionner plutôt que de risquer une révocation lors de l'assemblée générale annuelle qui a débuté vendredi soir.
"Le Dr Paisley a indiqué qu'il ne serait pas candidat au poste de modérateur du presbytère", a précisé l'assemblée dans un communiqué.
Agé de 81 ans, le pasteur occupe cette fonction depuis des années et a toujours été réélu. Mais il pourrait ne pas l'être en janvier, au terme de son actuel mandat.
Vendredi, une majorité de membres de l'assemblée s'étaient prononcés pour une séparation de l'Eglise et de l'Etat, une référence au statut de chef du gouvernement nord-irlandais, auquel participent les protestant du DUP et les catholiques du Sinn Féin.
L'intéressé, qui dirige le DUP depuis qu'il l'a fondé en 1971, n'a pas fait de commentaire. En mars dernier, il avait déçu nombre de ses partisans en acceptant de négocier puis de gouverner avec ses anciens ennemis du Sinn Féin, branche politique de l'Armée républicaine irlandaise (IRA).